9月下旬以後，太陽直射南半球，北半球大陸上的冷氣團勢力逐漸增強，位於高緯度的西伯利亞和蒙古的陸地較海洋冷，冷空氣向下沉，使地面空氣壓力增加，形成高氣壓，海洋則相對為低氣壓，風由亞洲內陸吹向海洋至臺灣形成東北季風。​10月以後風向漸穩定，天氣上表現較為明顯的改變是各地區的降雨，在冷空氣抵達臺灣之前，若在經過海面有吸收到較多的水氣時，臺灣北部及東北部經常會出現陰霾、飄著雨的天氣，但是西南部因位於中央山脈的西邊，東北風受地形阻擋，下雨機會遠較臺灣北部、東北部為少，因此進入乾季。​

北部地區在初進入秋季的9月份雨量與夏季的8月份相近，約為每日8毫米左右，但10月及11月時進一步減少為每日4至2毫米，其中11月為北部一年之中降雨最少的月份。東北部入秋之後雨量較夏季明顯增加，為整年中降雨最多的一段時間，雨量達每日15毫米。東部的降雨於8月達到顛峰，進入秋季後逐月遞減，11月時由9月及10月的每日9毫米減少至不到4毫米。中南部的降雨亦於8月達到顛峰，9月時還有8月的一半，10月後急遽減少。

在高層大氣，由於夏季季風的對流已經減弱，南亞高壓的中心重新回到中南半島的上空，而南亞高壓的跨赤道流依舊存在，但較夏季時已減弱很多。

在低層大氣的部分，陸地上東亞大陸北邊的冷高壓開始形成，低層風向由偏南風逐漸轉為偏北風；而在低緯度洋面上由於夏季風減弱，西北太平洋季風槽減弱消失、而南海及菲律賓海附近有秋槽產生，颱風生成位置也隨之移動。

北半球高層的反氣旋中心由中南半島回到西太平洋上空，雖然跨赤道流依舊存在，但又再進一步減弱。東亞北方北緯30度至40度上空，由於北半球斜壓度增強的關係，高空噴流持續加強。

陸地上東亞大陸北邊的冷高壓持續增強，熱帶區域北向跨赤道流消失，東亞地區轉為由穩定的東北季風所控制。在降雨方面，對流區域進一步南移，相對於赤道呈現南北對稱的結構。